生物与医学2015nature.com
阿尔茨海默病中不同脑区被真菌感染
Different Brain Regions Are Infected with Fungi in Alzheimer’s Disease
进阶 · 约 45 分钟读完前置知识：免疫组化基础、PCR 基础、神经病理学常识
导读
这篇论文声称在阿尔茨海默病患者脑部的多个区域检测到真菌感染，暗示真菌感染可能与阿尔茨海默病的发病有关。研究者使用免疫组化染色和 PCR 等方法在患者脑组织中检测到多种真菌。不过 HN 上的专业读者对方法学提出了严重质疑。
HN 关注点：如果真菌感染真是阿尔茨海默病的病因，将是影响巨大的突破性发现，但评论焦点集中在实验方法是否严谨、抗体是否真的染出了真菌。
HN 评论精选
这几条评论里：质疑 3 补充 1
质疑多克隆抗体特异性不明，染色结果难以解读
我做研究用的也是同样的方法：免疫组化。这项工作用的是兔多克隆抗体，关键就在“多克隆”上——我们根本不知道这些抗体实际染的是什么。不过这种差异本身确实很有意思。
niels_olson查看英文原文
Hi, I do research using the same methods: immunohistochemistry. This was done with rabbit polyclonal antibodies. The key being polyclonal. We don't know what those antibodies are really staining. The difference, however, is intriguing.
质疑缺乏定量、对照和抗体特异性验证，方法学不合格
作为生物医学研究者，我可以肯定地说这是粗糙的科学。论文没有对多个视野的染色差异做定量分析（无法证明图片不是手工挑选的），PCR 实验没有对照（结果也只在补充材料里展示了一个），也没有证明抗体不会结合淀粉样蛋白。非同寻常的主张需要非同寻常的证据，而这个水平连让我做后续研究的动力都没有。
thanatosmin查看英文原文
As a biomedical researcher, I'm confident in calling this sloppy science. There is no quantitation of staining differences across multiple fields (to demonstrate that the images aren't hand picked), no controls with the PCR study (or even showing the results besides one in the supplement), and no demonstration that the antibodies don't bind to amyloid. Extraordinary claims require extraordinary evidence, and this wouldn't even motivate me to perform a follow up study.
质疑抗体可能实际识别的是淀粉样蛋白而非真菌，解释了染色结果
我敢打赌，如果他们用抗β-淀粉样蛋白做双重染色，会发现染色是重叠的。他们只说用了针对多种念珠菌等蛋白制备的抗体，甚至不知道（或不想说）这些抗体到底和什么反应。淀粉样蛋白具有通用的二级结构（任何氨基酸序列在合适条件下都能形成），而酵母也会产生淀粉样蛋白。他们很可能制备的是针对酵母淀粉样蛋白的抗体，然后染出了人类的淀粉样蛋白。他们不报告对脑组织做β-淀粉样蛋白染色很奇怪，这是显而易见该做的事。
nonbel查看英文原文
I bet if they double stain with anti-amyloid-Beta they will see the staining overlap. They just say they used "antibody raised against proteins obtained from C. glabrata, C. famata, C. albicans, P. betae and S. racemosum", so they don't even know (or want to say) what these antibodies react with... Amyloids have generic secondary structure (can be created from any amino acid sequence under the right conditions) and yeast produce amyloids. They quite possibly raised antibodies towards yeast amyloids and then stained human amyloids. It is strange they do not report staining these brains for amyloid-Beta, it is an obvious thing to do.
补充期待但谨慎：若属实意义重大，需更多数据验证
如果真菌感染真的被证实是阿尔茨海默病的病因，很难不夸大这项研究的意义——这对人类影响太大了。我家就有一对祖父母患病，所以我希望这个结论是对的。下一步应该是用更多患者验证这个假说，然后争取批准药物试验（志愿者肯定不缺）。可以想见未来会有家属争相获取抗真菌药物，但在有更多数据之前我们无法知道是否有效。希望会有突破。历史上确实不乏发现某个极其简单/明显的东西最终成为关键答案的先例。顺带一提，有趣的是那些声称念珠菌感染是多种疑难疾病根源的“民间理论”可能某种程度上是对的。
Uptrenda查看英文原文
It's hard not to exaggerate the implications of this study if fungal infection does turn out to be the cause of AD given how huge this would be for humanity. Just off the top of my head I can say this disease has effected my family (1 set of grandparents effected by this disease so far) so I'd like for the conclusion to be correct. I guess the next step would be testing the hypothesis with more people with AD to see if it holds up and then somehow getting approval to do drug trials (and I'm sure there will be no shortage of volunteers.) I can almost see a clamouring of families trying to get their hands on anti-fungal drugs in the future in the hope that it helps their loved ones but we simply won't know if this will help until there's more data. Hoping for a break through. It's certainly not without precedent that we find something extremely simple / obvious that turns out to be the key. On a side note: it's interesting to think that the crack pots you see writing about candidas infections being the cause of numerous hard-to-treat illnesses -might- actually be right (in a sense.)
相关资源
从这篇论文所有 HN 讨论帖的全部评论里整理出来的链接。
历次讨论
- 2015Hacker News 讨论帖338 分 · 155 评
同领域还值得读
CRISPR 在活体动物中消除 HIV-1 感染
CRISPR eliminates HIV-1 infection in live animals
报告利用 CRISPR/Cas9 基因编辑技术在活体动物中清除 HIV-1 感染：研究人员通过腺病毒载体递送特定的 Cas9 系统，从被感染细胞中切除嵌入的 HIV 病毒 DNA。
生物与医学2017 · 1,455 分 · 239 评入门 · 约 30 分钟编辑精选保护区飞行昆虫生物量27年下降75%
75% decline over 27 years in total flying insect biomass in protected areas
这篇发表于 PLOS ONE 的研究通过在德国保护区长达 27 年的昆虫生物量监测，发现飞行昆虫总量下降了约 75%。
生物与医学2017 · 901 分 · 432 评入门 · 约 45 分钟编辑精选为什么大多数已发表的研究发现是错的
Why Most Published Research Findings Are False (2005)
这篇 2005 年发表于 PLOS Medicine 的经典论文由 John Ioannidis 撰写，论证了在统计功效不足、研究偏倚和多重检验等因素下，大多数已发表的医学研究发…
生物与医学2022 · 388 分 · 351 评入门 · 约 60 分钟编辑精选人类免疫系统的物理接线图
A physical wiring diagram for the human immune system
这篇 Nature 论文系统绘制了人类免疫系统的“物理接线图”：通过大规模实验鉴定免疫细胞表面受体之间的相互作用（包括约 30 种此前未知的受体互作），并结合定量计算模型模拟免疫…
生物与医学2022 · 342 分 · 49 评专业 · 约 90 分钟编辑精选脂肪组织在减重后仍保留肥胖的表观遗传记忆
Adipose tissue retains an epigenetic memory of obesity after weight loss
这篇 Nature 论文研究了肥胖对脂肪组织的长期影响：即使减重成功，脂肪细胞仍保留着肥胖时期的表观遗传记忆，可能解释为什么减重后容易反弹。
生物与医学2025 · 263 分 · 327 评进阶 · 约 45 分钟编辑精选